Aby uzyskać certyfikat ISO 14001, należy wdrożyć i spełnić wszelkie warunki normy oraz zgłosić firmę do certyfikacji w akredytowanej firmie. Jeśli podczas audytu nie zostaną znalezione żadne niedogodności lub organizacja zniweluje nieprawidłowości w odpowiednim czasie, wówczas uzyska certyfikację.
Organizacje starające się o uzyskanie certyfikatu ISO 14001 powinny zidentyfikować wymagania prawne i inne, które dotyczą środowiska, a także wskazać aspekty środowiskowe i podzielić je na te znaczące i nieistotne. Następnie organizacja musi postępować zgodnie z aspektami znaczącymi, dzięki którym skutecznie zadba o środowisko.